Kapal KLM Putra Natuna diketahui memiliki kapasitas 98 Gross Ton (GT) dengan jumlah awak sebanyak empat orang.

Sementara itu, kondisi cuaca di lokasi kejadian dilaporkan berawan dengan tinggi gelombang berkisar 1,0 hingga 1,1 meter.

Suhu udara berada pada kisaran 27 hingga 28 derajat Celsius dengan kecepatan angin 10–12 knot dari arah utara.